神仙鱼的品种大都出现在3~26公尺深度的海域中，也有品种生活在深度1公尺不到的海域中，当然，也有品种，例如：皇后神仙有时候也可能被发现在60公尺深的海域中。自然的分布地点对此属的某些品种是有相当取限制的，关于阿拉伯神仙和黄圈神仙只在太平洋东岸的固定海域发现，此有特定且狭窄分布区域的品种，对神仙鱼来说，是典型的例子。
许多神仙鱼的品种分布区域广泛，遍及太平洋及印度洋的各种区域，这些不同地区包括：新几内亚、马来西亚、印尼、非洲东岸、大堡礁、澳洲西部、所罗门群岛、新加勒多西亚、菲律宾群岛、塞席尔群岛，以及红海海域，皇后神仙和蓝纹神仙(circ-ulatus)在上述的地方都有分布，也是分布区域最广的品种。